Baza Danych Ligandów Bia¿ek

Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektów dotycz-cych zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania leków. Projekty b-d-ce tematem pracy to baza danych ligandów biäek LIGANSdb oraz program do analizy rozk-adu oddziäywä w biäku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dost-pny pod adresem http://crick.cm-uj.krakow.pl/ligandsdb. LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobów: przeszukiwanie po nazwach biäek dostarczaj-ce listy ligandów, które wi-- si- z dan- protein- oraz przeszukiwanie po nazwach ligandów którego rezultatem jest lista biäek, do których dany ligand si- wi--e. Dodatkowo przy kädym biäku zä-czona jest informacja o pe-nionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC biäka je-eli kod taki posiada. Serwis ten powstä w oparciu o baz- danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksów biäko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozk-adów oddziäywä w biäku z naciskiem na ob-szar miejsca wi---cego ligand.

Jestem doktorantem biofizyki na Wydziale Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej na Uniwersytecie Jagiello-skim. Gdzie realizuj- projekty: "Rola laktoferyny poddanej metalacji i transmetalacji w regulacji mikroflory przewodu pokarmowego oraz jej interakcje z komórkami nab-onka jelita" oraz "System Informatyczny Redukcji Szpitalnych Zakäe-".