Monta¿ i finalizacja genomów prokariotycznych z mapowaniem optycznym

Ci-g-e ulepszanie platform sekwencjonowania DNA skraca czas potrzebny na odczytanie i identyfikacj- genomów przy coraz ni-szych kosztach. Jednak sekwenatory nadal maj- pewne ograniczenia, takie jak rozmiar fragmentów DNA, które s- w stanie zidentyfikowä. W zwi-zku z tym DNA jest fragmentowane przed sekwencjonowaniem, a po tym etapie ponownie porz-dkowane tak, aby mog-o reprezentowä oryginalny genom. Proces ten, znany jako montä genomów, wymaga zastosowania ró-nych strategii in vitro i in silico. W ostatnich latach zaproponowano ró-ne strategie montäu genomów, jednak nadal nie ma zgody co do najlepszego podej-cia. Ostatnio wiele genomów zostäo uko-czonych przy u-yciu techniki znanej jako optyczne mapowanie cäego genomu (WGM). Technika ta pozwala na montä wysokiej jako-ci na podstawie bardzo dok-adnej mapy restrykcyjnej. Mapa restrykcyjna umo-liwia orientacj- i uporz-dkowanie kontigów bez konieczno-ci stosowania genomu referencyjnego. Mapowanie optyczne pozwoli na nadej-cie nowej ery szybszego, täszego i coraz dok-adniejszego montäu genomów.

Diego Mariano obecnie studiuje na kierunku bioinformatyka na Uniwersytecie Federalnym w Minas Gerais. Posiada tytu- magistra bioinformatyki oraz licencjata w dziedzinie systemów informatycznych. Ma döwiadczenie w tworzeniu systemów internetowych, umiej-tnöci programowania w j-zykach PHP, Python i Perl, a tak-e wiedz- z zakresu bioinformatyki.