Bioinformatik

Wie berechnet man multiple Alignments? Wie nutzt man eine Datenbank, um die im Labor ermittelten Sequenzen effektiv zu analysieren? Locker und leicht verständlich führt der Leitfaden in die Geheimnisse der Bioinformatik ein. Schwerpunkt sind die Grundlagen und verschiedenen Möglichkeiten der Sequenzanalyse. Am Anfang steht eine Einführung in die wichtigen Sequenzdatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die Motivdatenbanken. Die Autorin beschreibt die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments und erklärt die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST).

1 Einstieg in die Sequenzanalyse.- 2 Primäre Datenbanken.- 3 Sequenzformate.- 4 Einfache Alignments.- 5 Heuristische Methoden zum Sequenzvergleich.- 6 Multiple Alignments.- 7 Phylogenetische Analysen.- 8 Abgeleitete Datenbanken.- 9 Primerdesign.- 10 Genomanalyse.- Weblinks.