Les communautés microbiennes des sources hydrothermales du Pacifique

Cet ouvrage est une réédition, sans remise à jour, d''une thèse de doctorat soutenue en 2003. Une étude des assemblages microbiens associés aux polychètes hydrothermaux Alvinellidae a été réalisée en combinant des approches culturales et moléculaires. Une première étape du travail, basée sur des techniques de phylogénie moléculaire, a permis d''identifier les populations microbiennes associées à trois espèces d''alvinelles. Des approches culturales ont permis d''améliorer nos connaissances de la microflore du micro-environnement de ces polychètes. Des bactéries autotrophes réduisant le soufre et/ou les nitrates et des bactéries fermentaires ont notamment fait l''objet d''une caractérisation physiologique: Caminicella sporogenes, Desulfurobacterium crinifex et Caminibacter hydrogeniphilus. Cette dernière est la première Epsilonproteobacteria isolée des sources hydrothermales profondes. Des études ultrastructurales et chimiques de macrofilaments extrêmement atypiques formés en culture par Desulfurobacterium crinifex ont également été effectuées. Enfin, des expérimentations de colonisation de supports vierges ont été menées in situ dans le cadre d''une étude intégrée pluridisciplinaire.

Karine Alain, docteur en microbiologie, a fait des études de microbiologie et d''écologie moléculaire à l''université de Bretagne Occidentale (thèse) et à l''institut Max Planck de Brême (post-doctorat). En 2007, elle a été recrutée au CNRS (UMR6197, LM2E, Brest) en qualité de chercheuse. Elle s''intéresse aux procaryotes des environnements extrêmes.