Identificazione in silico dei microrazzi e dei loro bersagli nella lenticchia

In questo lavoro, è stato adottato un approccio in silico per l'identificazione e la caratterizzazione dei miRNA conservati nei tag di sequenza espressa (EST) della lenticchia. Per l'identificazione di nuovi miRNA nella lenticchia, le sequenze EST sono state ricercate per omologia rispetto ai miRNA maturi noti del regno vegetale Viridiplantae tramite BLASTN online. L'identificazione computazionale basata sulla genomica comparativa ha permesso di individuare 12 potenziali candidati miRNA appartenenti a 12 diverse famiglie di miRNA nella lenticchia. Infine, utilizzando i potenziali miRNA dell'aglio, sono stati predetti 25 geni bersaglio e sono state illustrate le loro probabili funzioni. La maggior parte dei geni bersaglio dei miRNA della lenticchia sembra codificare la crescita, lo sviluppo, il metabolismo e la risposta allo stress, la resistenza alle malattie, ecc. In un prossimo futuro, una migliore comprensione dei meccanismi molecolari dei miRNA nella pianta di lenticchia potrebbe aiutare a sviluppare tecniche nuove e precise per comprendere alcuni meccanismi di silenziamento genico post-trascrizionale in risposta alla tolleranza agli stress.

O Dr. RISHEE K. KALARIA concluiu o seu doutoramento em biologia molecular e biotecnologia vegetal na Universidade Agrícola de Navsari em 2014. Atualmente, trabalha como Professor Assistente no Instituto de Biotecnologia Aspee Shakilam, Universidade Agrícola de Navsari. É também responsável pela secção de bioinformática.